From dd80cd0839738e34a090863ebdf0264a68ba3a64 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: GBIF Crowdin Date: Fri, 12 Jul 2024 11:52:30 +0200 Subject: [PATCH] New Crowdin updates (#203) * New translations index.pot (Spanish) * New translations index.pot (Spanish) * New translations index.pot (Spanish) * New translations index.pot (Spanish) --- translations/es.po | 18 +++++++++--------- 1 file changed, 9 insertions(+), 9 deletions(-) diff --git a/translations/es.po b/translations/es.po index 8281b0f..1b372c3 100644 --- a/translations/es.po +++ b/translations/es.po @@ -2,7 +2,7 @@ msgid "" msgstr "" "Project-Id-Version: publishing-ddd\n" "POT-Creation-Date: 2024-03-19 10:11+0000\n" -"PO-Revision-Date: 2024-03-19 10:13\n" +"PO-Revision-Date: 2024-04-02 22:45\n" "Last-Translator: \n" "Language-Team: Spanish\n" "Language: es_ES\n" @@ -532,43 +532,43 @@ msgstr "Las secuencias pre-procesadas pueden ser asignadas a un taxón al compar #. type: Plain text #: 100.en.adoc:110 msgid "The PCR used for generating the sequencing library can result in the generation of artefactual sequences in the form of chimeras; a single sequence that originates from multiple parent sequences. Such sequences can be detected bioinformatically and removed, and this is typically done after denoising." -msgstr "" +msgstr "El PCR utilizado para generar la biblioteca de secuenciación puede resultar en la generación de secuencias artefactuales en forma de quimeras; una secuencia única que se origina a partir de múltiples secuencias parentales. Estas secuencias pueden ser detectadas bioinformáticamente y eliminarse, y esto se hace típicamente después del denoising." #. type: Plain text #: 100.en.adoc:112 msgid "Finally, the pre-processed sequences, OTUs or ASVs, are taxonomically classified by comparing them to a database of annotated sequences (often referred to as reference libraries, see <>). As with the previous steps, several alternative methods are available. Most of these are either based on aligning the metabarcoding sequences to the reference sequences or on counting shared k-mers (short exact sequences)." -msgstr "" +msgstr "Finalmente, las secuencias preprocesadas, OTU o ASV, son clasificadas taxonómicamente al compararlas con una base de datos de secuencias anotadas (a menudo referidas como bibliotecas de referencia, véase <>). Como en los pasos anteriores, varios métodos alternativos están disponibles. La mayoría de estos se basan en alinear de las secuencias de metabarcoding con las secuencias de referencia o en contar los k-mers compartidos (secuencias cortas exactas)." #. type: Plain text #: 100.en.adoc:114 msgid "Several open source tools and algorithms exist for bioinformatic processing of metabarcoding data (QIIME2 https://doi.org/10.1038/s41587-019-0209-9[(Bolyen et al. 2019)^], DADA2 https://doi.org/10.1038/nmeth.3869[(Callahan et al. 2016)^], SWARM https://doi.org/10.7717/peerj.593[(Mahé et al. 2014)^], USEARCH https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btq461p[(Edgar 2010)^], Mothur https://doi.org/10.1128/AEM.01541-09[(Schloss et al. 2009)^], LULU https://doi.org/10.1038/s41467-017-01312-x[(Frøslev et al. 2017)^], PROTAX https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btw34[(Somervuo et al. 2016)^], VSEARCH https://doi.org/10.7717/peerj.2584[(Rognes et al. 2016)^]). Given the existence of many popular and well used workflows, we make some recommendations below on analysing data for submission to biodiversity data platforms. This is not to suggest that these are the best methods or most appropriate for all purposes but is an attempt to encourage submission of relatively standardized data that may readily be compared via the platforms. If possible, a well documented and maintained workflow should be used (e.g. https://nf-co.re/ampliseq[nf-core/ampliseq pipeline]). Metadata should include workflow details and versions either in the metadata method steps or as a reference in the SOP field in the DNA derived data extension (see mapping in <>). Sequence data should be deposited in an appropriate nucleotide archive (NCBI’s SRA: https://doi.org/10.1093/nar/gkq1019[Leinonen et al. 2011^]) or EMBL’s ENA (https://doi.org/10.1093/nar/gkz1063[Amid et al. 2020^])) and data submitted to the biodiversity platform should include the biosample ID obtained from the archive (see data mapping in <>). Making use of these sample IDs will reduce the chances of duplication and ensure sequence data are readily obtainable should opportunities for re-analysis arise, as reference libraries and bioinformatic tools improve. The core end-product of these pipelines is typically a file of counts of individual OTUs or ASVs in each sample along with the taxonomy assigned to these. This is generated either in tabular format or in the BIOM format (https://doi.org/10.1186/2047-217X-1-7[McDonald et.al 2012^]). OTU or ASV sequences are also often provided in the FASTA format (https://doi.org/10.1073/pnas.85.8.2444[Pearson & Lipman 1988^])." -msgstr "" +msgstr "Existen varias herramientas y algoritmos de código abierto para el procesamiento bioinformático de datos de metabarcoding (QIIME2 https://doi.org/10.1038/s41587-019-0209-9[(Bolyen et al. 2019)^], DADA2 https://doi.org/10.1038/nmeth.3869[(Callahan et al. 2016)^], SWARM https://doi.org/10.7717/peerj.593[(Mahé et al. 2014)^], USEARCH https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btq461p[(Edgar 2010)^], Mothur https://doi.org/10.1128/AEM.01541-09[(Schloss et al. 2009)^], LULU https://doi.org/10.1038/s41467-017-01312-x[(Frøslev et al. 2017)^], PROTAX https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btw34[(Somervuo et al. 2016)^], VSEARCH https://doi.org/10.7717/peerj.2584[(Rognes et al. 2016)^]). Dada la existencia de muchos flujos de trabajo populares y bien utilizados, a continuación hacemos algunas recomendaciones sobre el análisis de datos para enviarlos a plataformas de datos sobre biodiversidad. Esto no sugiere que estos sean los mejores métodos o los más apropiados para todos los fines, sino que es un intento de fomentar la presentación de datos relativamente estandarizados que puedan compararse fácilmente a través de las plataformas. Si es posible, debería utilizarse un flujo de trabajo bien documentado y mantenido (por ejemplo, https://nf-co.re/ampliseq[nf-core/ampliseq pipeline]). Los metadatos deben incluir los detalles del flujo de trabajo y las versiones, ya sea en los pasos de los métodos en los metadatos, o como referencia en el campo SOP en la extensión de datos derivados de ADN (ver el mapeo en <>). Los datos de secuencia deben depositarse en un archivo de nucleótidos apropiado ((NCBI’s SRA: https://doi.org/10.1093/nar/gkq1019[Leinonen et al. 2011^]) or EMBL’s ENA (https://doi.org/10.1093/nar/gkz1063[Amid et al. 2020^])) y los datos enviados a la plataforma de biodiversidad deben incluir el biosample ID obtenido del archivo (ver mapeo de datos en <>). Hacer uso de estos identificadores reducirá las posibilidades de duplicación y asegurará que los datos de secuencia sean fácilmente alcanzables en caso de que surjan oportunidades de reanálisis a medida que mejoren las bilbiotecas de referencia y las herramientas bioinformáticas. El producto final principal de estos pipelines es típicamente un archivo de recuentos de OTUs o ASVs individuales en cada muestra junto con la taxonomía asignada a estos. Lo anterior se genera en formato tabular o en formato BIOM (https://doi.org/10.1186/2047-217X-1-7[McDonald et.al 2012^]). Las secuencias OTU o ASV también se proporcionan a menudo en formato FASTA ((https://doi.org/10.1073/pnas.85.8.2444[Pearson & Lipman 1988^])." #. type: Title === #: 100.en.adoc:115 #, no-wrap msgid "Taxonomy of sequences" -msgstr "" +msgstr "Taxonomía de secuencias" #. type: Plain text #: 100.en.adoc:118 msgid "Taxonomic annotation of sequences is a critical step in the processing of molecular biodiversity datasets, as scientific names are key to accessing and communicating information about the observed organisms. The accuracy and precision of such sequence annotation will depend on the availability of reliable reference databases and libraries across all branches of the tree of life, which in turn will require joint efforts from taxonomists and molecular ecologists. Public sequence databases should always be used knowingly of the fact that they suffer from various shortcomings related to, e.g., taxonomic reliability and lack of standardized metadata vocabularies (https://doi.org/10.1007/s13225-019-00428-3[Hofstetter et al. 2019^]; https://doi.org/10.3897/mycokeys.72.56691[Durkin et al. 2020^])." -msgstr "" +msgstr "La anotación taxonómica de secuencias es un paso crítico en el procesamiento de los conjuntos de datos de biodiversidad molecular, ya que los nombres científicos son clave para acceder y comunicar información sobre los organismos observados. La exactitud y precisión de tal anotación de secuencia dependerá de la disponibilidad de bases de datos de referencia fiables y bibliotecas en todas las ramas del árbol de la vida, que a su vez requerirá esfuerzos conjuntos de taxónomos y ecólogos moleculares. Las bases de datos de secuencia pública siempre deben ser utilizadas a sabiendas del hecho de que sufren de diverdad deficiencias relacionadas, por ejemplo, con la confiabilidad taxonómica y la falta de vocabularios de metadatos estandarizados (https://doi.org/10.1007/s13225-019-00428-3[Hofstetter et al. 2019^]; https://doi.org/10.3897/mycokeys.72.56691[Durkin et al. 2020^])." #. type: Plain text #: 100.en.adoc:120 msgid "Species, as described by taxonomists, are central to biology and attempts at characterizing biodiversity may therefore make use of the end products of taxonomic research. However, unlike DNA sequence data, taxonomic outputs are not always readily amenable to direct algorithmic or computational interpretation: classical taxonomy is a human-driven process which includes manual steps of taxon delimitation, description and naming, culminating in a formal publication in accordance to the international Codes of Nomenclature. As discussed in previous chapters, DNA sequence-based surveys are very effective at detecting hard to observe species and will often identify the presence of organisms currently outside traditional Linnaean taxonomic knowledge. While these guidelines do not address the publication of alternative species checklists derived from sequence data, the disconnection between traditional taxonomy and eDNA efforts is undesirable. Therefore we offer the following recommendations to readers of this guide." -msgstr "" +msgstr "Las especies, tal como las describen los taxónomos, son fundamentales para la biología y, por lo tanto, los intentos de caracterizar la biodiversidad, pueden utilizar los productos finales de la investigación taxonómica. Sin embargo, a diferencia de los datos de la secuencia de ADN, las salidas taxonómicas no siempre son fácilmente susceptibles a la interpretación algorítmica directa o computacional: la taxonomía clásica es un proceso impulsado por el hombre que inclye pasos manuales de delimitación de taxones, descripción y nombramiento, culminando en una publicación formal de acuerdo con los Códigos internacionales de Nomenclatura. Como se discutió en capítulos anteriores, los estudios basados en secuencias de ADN son muy eficaces para detectar especies difíciles de observar y, a menudo, identificarán la presencia de organismos que actualmente están fuera del conocimiento taxonómico tradicional de Linneo. Si bien estas directrices no abordan la publicación de listas de especies alternativas derivadas de datos de secuencia, la desconexión entre la taxonomía tradicional y los esfuerzos del ADN ambiental es indeseable. Por ello ofrecemos las siguientes recomendaciones a los lectores de esta guía." #. type: Plain text #: 100.en.adoc:122 msgid "As taxonomy is central to the discovery of biodiversity data, it is highly recommended that any eDNA sequencing efforts should seek to include relevant taxonomic expertise in their study. It will similarly be beneficial if eDNA sequencing studies are able to allocate a portion of their budget to generation and release of reference sequences from previously unsequenced type specimens or other important reference material from the local herbarium, museum, or biological collection. Taxonomists, too, can contribute towards this goal by always including relevant DNA sequences with each new species description (https://doi.org/10.1093/sysbio/syaa026[Miralles et al. 2020^]) and by targeting the many novel biological entities unravelled by eDNA efforts (e.g. https://doi.org/10.1186/s40168-017-0259-5[Tedersoo et al. 2017^])." -msgstr "" +msgstr "Dado que la taxonomía es fundamental para el descubrimiento de datos sobre biodiversidad, es altamente recomendable que con cualquier esfuerzo de secuenciación de ADN ambiental se busque incluir experiencia taxonómica relevante en su estudio. De manera similar, será beneficioso si los estudios de secuenciación de ADN ambiental puedan asignar una parte de su presupuesto a la generación y publicación de secuencias de referencia a partir de especímenes tipo no secuenciados previamente u otro material de referencia importante del herbario, museo o colección biológica local. Los taxónomos también pueden contribuir a este objetivo incluyendo siempre secuencias de ADN relevantes con cada descripción de una nueva especie (https://doi.org/10.1093/sysbio/syaa026[Miralles et al. 2020^]) y centrándose en las muchas entidades biológicas novedosas desveladas por los esfuerzos del ADN ambiental (por ejemplo, https://doi.org/10.1186/s40168-017-0259-5[Tedersoo et al. 2017^])." #. type: Plain text #: 100.en.adoc:124 msgid "Most current biodiversity data platforms are organized around traditional name lists and taxonomic indexes. As DNA sequence-derived occurrences are rapidly becoming a significant source of biodiversity data, and as official taxonomy and nomenclature for such data lags, it is recommended that data providers and platforms should continue to explore and include more flexible representations of taxonomy into their taxonomic backbones. These new representations include molecular reference databases (e.g., GTDB, BOLD, UNITE) that recognize sequence data as reference material for previously unclassified organisms. Additionally, we suggest other commonly used molecular databases (e.g., PR2, RDP, SILVA) should develop stable identifiers for taxa and make reference sequences available for those taxa, to allow their use as taxonomic references." -msgstr "" +msgstr "La mayoría de las plataformas de datos sobre biodiversidad actuales están organizadas en torno a listas de nombres e índices taxonómicos tradicionales. Dado que las ocurrencias derivadas de secuencias de ADN se están convirtiendo rápidamente en una fuente importante de datos sobre biodiversidad, y como la taxonomía y nomenclatura oficiales para dichos datos van retrasadas, se recomienda que los proveedores de datos y las plataformas continúen explorando e incluyendo representaciones más flexibles de la taxonomía en sus árboles taxonómicos. Estas nuevas representaciones incluyen bases de datos de referencia molecular (por ejemplo, GTDB, BOLD, UNITE) que reconocen los datos de secuencia como material de referencia para organismos no clasificados previamente. Además, sugerimos que otras bases de datos moleculares de uso común (por ejemplo, PR2, RDP, SILVA) desarrollen identificadores estables para taxones y pongan a disposición secuencias de referencia para esos taxones, para permitir su uso como referencias taxonómicas." #. type: Plain text #: 100.en.adoc:126